สำนักงานทรัพยากรธรรมชาติและสิ่งแวดล้อมจังหวัดตาก ได้จัดตั้งหน่วยงานภายในเพื่อให้สอดคล้อง ตามคำสั่งสำนักงานปลัดกระทรวงทรัพยากรธรรมชาติและสิ่งแวดล้อม ประกอบด้วย 
 
1. ส่วนอำนวยการ
 
2. ส่วนสิ่งแวดล้อม
 
3. ส่วนทรัพยากรธรรมชาติ
 
4. ส่วนทรัพยากรน้ำ

5. ส่วนยุทธศาสตร์และสารสนเทศ